Истражувачи од Кина и Германија за прв пат целосно го дешифрираа геномот на компирот, пренесува ТАСС. Ова им помогна да ја откријат еволутивната историја на ова растение и да ги истакнат клучните области на ДНК поврзани со растот и отпорноста на болести. Информација за ова објави прес-службата на Германскиот институт за одгледување растенија (IPZ).
„Секвенционирањето на геномот на компирот ќе ни овозможи да започнеме програми за одгледување со високи перформанси кои ќе создадат нови сорти кои се високопродуктивни, а сепак отпорни на глобалното затоплување, што ќе биде критично во наредните децении“, рече професорот на ИПЗ, Корбинијан Шнебергер.
Многу габични и бактериски болести го попречуваат одгледувањето на компирот, како и разни штетници како Колорадо компир бубачки и нематоди. Научниците и одгледувачите се обидуваат да се борат со нив создавајќи нови сорти на конвенционални и генетски модифицирани компири.
Професорот Шнебергер и неговите колеги дошле до потенцијално решение за овој проблем во огромен проект чија цел е целосно да се секвенционира геномот на компирот. Во минатото, научниците веќе се обидоа да ги добијат овие информации, но тоа беше попречено од исклучително сложената структура на геномот на компирот - тој се состои од четири идентични групи на хромозоми кои содржат голем број повторувања.
Новите технологии за секвенционирање на ДНК и алгоритми за анализа на генетски информации им помогнаа на германските и кинеските генетичари да го решат овој проблем за сортата Отава. За да го дешифрираат геномот, научниците собрале голем број поленови зрна, чиј генетски материјал содржи само две, а не четири копии од хромозомите.
Овој пристап во голема мера ја поедностави задачата, но во исто време бараше декодирање на многу голем број фрагменти на ДНК и нивна последователна комбинација со користење на компјутерски алгоритми. На крајот, научниците добија виртуелна копија од целосниот геном на компирот, кој се состои од приближно 3,1 милијарди генетски „букви“ - нуклеотиди и содржи над 38 гени.
Последователната анализа на нивната структура ја откри сложената еволутивна историја на компирот. Научниците открија дека оваа култура релативно неодамна го преживеала удвојувањето на геномот како резултат на инбродирање. Покрај тоа, научниците открија невообичаени разлики во нивото на активност на копии од исти гени лоцирани на различни хромозоми, што потенцијално влијае на ефикасноста на вкрстувањето на различни сорти компири.
Оваа информација, се надеваат научниците, ќе помогне да се размножуваат нови сорти или да го модифицираат геномот на таков начин што компирот ќе расте побрзо, подобро ќе се спротивстави на доцната болест и други болести, а исто така ќе биде помалку подложен на различни фактори на стрес.