Од соработката помеѓу науката и индустријата произлезе иновативен метод за борба против болести на земјоделските култури користејќи локални корисни бактерии на почвата.
Тим научници од Центарот Џон Инс (Велика Британија) изолираше и тестираше стотици видови на бактерии Pseudomonas од почва собрана од фарми, а потоа ги секвенционираа геномите на 69 од нив.
Со споредување на геномите на оние соеви кои ја инхибираат активноста на патогенот со оние кои не ја инхибираат активноста на патогенот, тимот успеа да идентификува клучен механизам за заштита на културата на компирот од штетни бактерии.
Потоа, користејќи комбинација од хемија и генетика и низа експерименти, научниците покажаа дека производството на мали молекули наречени циклични липопептиди е важно за контрола на краста на компирот (бактериска болест која предизвикува значителна штета на родот на компирот). Овие мали молекули имаат антибактериски ефект врз патогените бактерии кои предизвикуваат краста и им помагаат на корисните бактерии Pseudomonas да мигрираат и да ги колонизираат корените на растенијата.
Експериментите исто така покажаа дека наводнувањето предизвикува значителни промени во генетски разновидната популација на Pseudomonas во почвата.
Студијата, објавена во eLife, нуди метод со кој научниците можат да го проучуваат микробиомот на практично секоја област на полето и да ги земат предвид различните почвени, агрохемиски и еколошки услови.
Користејќи го напредокот во генетското секвенционирање со голема брзина, научниците можат да го тестираат микробиомот на почвата за корисни бактерии и да утврдат кои молекули се произведуваат за да ги потиснат патогените. Следниот чекор е размножување и враќање на корисни микроорганизми на истото поле.
Потенцијалните апликации за подобрувачи на микробиомот вклучуваат нанесување бактериски коктели на површината на клубени како прскање или директно во почвата со наводнување капка по капка.